Softwarová vrstva mezi WMS a WCS, která v reálném čase orchestruje práci mezi lidmi a automatizačními zařízeními a dynamicky rozhoduje, jak nejefektivněji rozdělit a naplánovat aktuální úkoly (např. které objednávky poslat k goods-to-person stanici a které vychystat ručně). WES bývá nasazován tam, kde WMS řeší hlavně evidenci zásob a byznysovou logiku, ale chybí mu schopnost sofistikovaně plánovat a vyvažovat vytížení kombinovaného provozu lidí a robotů v reálném čase. Hranice mezi WMS, WES a WCS nejsou u jednotlivých dodavatelů softwaru vždy stejně ostré a v praxi se funkce často prolínají.
